白天发射
与以往神舟系列发射时间不同，神舟五号载人飞船选择了白天。
以往神舟飞船的发射时间一般在凌晨和子夜。据有关专家介绍，航天发射需要确定一天中的某一个时间段作为飞船发射的时机，这个时间段被称为“发射窗口”。原来神舟系列的发射窗口选择在夜晚，主要是便于飞船发射升空时，地面的光学跟踪测量仪易于捕捉到目标。而神舟五号载人飞船选择白天发射，主要是考虑到白天温度将有利于发射人员工作，也易于在意外情况发生时，充分保障航天员的人身安全。
保障人员安全，成了首要任务
神舟五号载人飞船与四号飞船基本相似，由推进舱、轨道舱、返回舱和附加段组成。所不同的是五号的头部是圆柱体，而四号的头部是半球体。神舟四号飞船里面装满了实验仪器和物品，而神舟五号载人飞船舱内只有航天员，几乎是空荡荡的，为的是尽可能给航天员留出空间，其空间的平面大约为2．2米×2．5米，不足6平方米，可容纳3名航天员。此外，神舟五号载人飞船还留有将来与空间实验室对接的接口。
在此次神舟五号载人飞船的发射中，长征2Ｆ火箭的逃逸系统将首次为航天员的安全提供保护。在发射前15分钟，火箭上的自动故障检测处理系统可以自动进行故障检测，一旦有问题便会自动报警。
发射载人飞船的运载火箭，不仅要具有大的运载能力，而且因为要载人，所以一般要比发射卫星的运载火箭具有更高的可靠性和安全性。根据介绍，“长征”2Ｆ火箭的独特之处就在于中国自己制造的火箭首次按照安全性进行设计，可靠性指标由不载人火箭的0．91提高到0．97，即发射100次火箭可能只有3次出现问题；航天员安全性指标为0．997，即发生1000次危险，只有3次救助失败。
神舟五号载人飞船进一步完善了飞船应急救生系统，从飞船起飞到着陆都精心设计了救生方案。
针对航天员的安全问题，神舟五号载人飞船总设计师戚发轫院士曾经表示，中国有信心保证航天员的安全。他说：“我们在设计飞船时有一个原则，就是飞船的每一个系统要做到‘一次故障，正常飞行；二次故障，安全返回’。”
